慧持有个姑姑是尼姑，名道仪，住在江夏。道仪听说京师佛法盛行，欲到京师观察教化。慧持送姑姑到京城，住于东安寺。晋卫军琅邪王殉，对慧持非常器重。当时有位西域僧人僧伽罗叉，善诵四种《含经》，王殉请僧伽罗叉翻译《中阿含经》，慧持校阅文字，最后定稿。后又回到庐山。
过了没多久，豫章太守范宁，请慧持讲说《法华经》和《毗昙经)，听众不远千里，四方云集。王砌在结范宁的信中说：“慧远与慧持两人谁更强一些?”范宁回答说：“他们是一对贤兄弟啊!”王又写信说：“假如兄长城未易有，是不是弟弟更贤良一些?”充州刺史王恭在给沙门僧检的信中说：“慧远、慧持兄弟至德如何?”僧检回答说：“慧远、慧持兄弟两人，绰然有信，道风高尚。”罗什在关中，与慧远、慧持兄弟遥相钦敬，致信问好，结为善友。
后来慧持听说成都一带土地肥沃，人民富裕，有志前往传扬教化，同时还可以观瞩峨嵋山水。慧持于东晋隆安三年(公元399年)辞别慧远到四川去。慧远苦留不住，叹道：“人们都喜爱欢聚，唯有你却乐于分离，这是为什么？”慧持也很悲伤地说：“若是滞情爱聚之人，就不应该出家。现在我们既已割舍己欲而求道，就应以西方极乐国为期。”于是兄弟两人收诏，悯默而别。
慧远走到荆州，刺史殷仲堪给予很隆重的礼遇。当时桓玄也在荆州，桓玄虽然学功疏浅，却一往神出，贝慧持独绝超拔，叹为古今无比之人，很想与慧持结交。但慧持认为桓玄酌为人不好，便不与他结交往来。殷仲堪、桓玄二人苦欲留下慧持，慧持越加不愿停日
临走的时候，给桓玄留下一封信，信中说：
我的愿望是栖于峨媚山之峰峦，观察教化流沙之表，我个能违背我的意愿，就束装上路了。
桓玄收到信后，感到非常惆怅，明白无法阻止慧持西行。慧持来到四川，住在龙渊寺，大力弘扬佛法，受到四方人士的钦慕，刺史毛琼更是雅相推崇。
在当时，僧人慧岩、僧慕，已先在眠蜀，受到当地人的尊敬，待慧持来后，人们都望风推服，以至于凡是来到慧持僧堂的人，都被称作“登龙门”。
僧慕幼年时就很有才华，为蜀郡僧官。慧岩博学多识，素为毛蔗所敬重。后来，蜀人谯纵，杀死毛璩，割据蜀郡，自称成都王。纵召集僧人，设立斋会，逼请慧岩，慧岩不得已只好去了。因毛璩与慧岩是多年的朋友，现在被人杀害，慧岩睹事增悲，痛形于色，因此，遭到谯纵的忌恨，就将慧岩杀了，人们都感到非常害怕、恐慌。慧持避乱来到郸县，住在中寺。谯纵有个侄子名道福，凶残无比，带兵来到郸县，到处杀人，血流成河，道福来到寺中，众僧人很害怕，纷纷逃跑了。慧持在房中盟洗，神色安详，道福来到慧身边，慧持弹指洒水，淡然自若，道福愧悔而汗流满面，灰溜溜地了。出了寺
